2018年8月13日至30日,无锡万物生态科技有限公司对南通市港闸区、崇川区、海门市进行了鱼类调查、浮游生物和底栖动物的中期调查工作。其中鱼类调查样点分别为港闸区5个、崇川区10个、海门市10个、启东市10个;本次四个地区调查到鱼类主要为刀鲚、蛇鮈、银鮈、䱗、贝氏䱗、光泽黄颡鱼、黄颡鱼、香䲗、中国花鲈、似鳊、鳊、鲫、赤眼鳟、达氏鲌、翘嘴鲌、红鳍原鲌、蒙古鲌、麦穗鱼、棒花鱼、子陵吻鰕虎、大鳍鱊、兴凯鱊、革条鱊、鳑鲏、鳜、沙塘鳢、乌鳢、锦鲤、鲤、小黄䱂鱼等三十多种鱼类。浮游生物调查样点多于其他样点,其中部分封闭水体水色呈绿色、蓝藻较多;长江边点位受江水涨落潮影响,水样较为浑浊,浮游动植物量较少;底栖生物调查到种类较少,多受河道底质清淤等影响。